生活在新南威尔士州北部和昆士兰的土著澳大利亚人是最早发现柠檬香桃木鲜艳风味和治愈力量的人。
数千年来，第一批澳大利亚人将这种多用途的本土开花植物用于他们的烹饪和医学。早期的例子包括用纸皮包裹的叶子烹饪以调味鱼类菜肴；以及捣碎并吸入叶子作为镇静剂和治疗头痛。
当英国人殖民澳大利亚并开始作为定居者到达时，他们也对柠檬香桃木印象深刻。植物学家费迪南德·冯·穆勒于1853年赋予其科学名称Backhousia citriodora，以他的朋友詹姆斯·巴克豪斯的名字命名该属，詹姆斯是一位贵格会传教士和植物学家。
不久之后，商业生产随之而来，早期的先驱约瑟夫·H·梅登在1889年记录了柠檬香桃木的可市场用途。但直到20世纪，柠檬香桃木的抗菌特性才被研究，1925年首次正式报告了柠檬香桃木精油。
柠檬香桃木的早期商业用途是在第二次世界大战期间作为柠檬水的调味料，然而在战后几年，树木的商业生产下降，其他植物如香茅取代了它作为调味和香料。
直到1990年代，柠檬香桃木的好处、气味和风味才被“重新发现”，商业种植再次开始。澳大利亚本土产品（ANP）是本土植物种植的先驱，在1990年代末在查农建立了一个小型的柠檬香桃木和八角香桃木种植园。这个位于新南威尔士州北部的地区坐落在雨林的边缘，环绕着通往受欢迎的海滨小镇拜伦湾的山丘和山谷。
查农柠檬香桃木种植园现已扩大到110公顷，并在昆士兰州远北的马里巴种植了更多。ANP现在是世界上最大的柠檬香桃木种植和出口商，世界各地的人们正在发现它的治疗、消毒、芳香和烹饪能力。